• Pruebas de función respiratoria.
• Broncoscopia diagnóstica y terapeútica.
• Toracocentesis y biopsia pleural percutánea.
• Poligrafía respiratoria.
• CPAP.
• Ventilación mecánica no invasiva.

• Participación como investigador principal y como investigador secundario en múltiples proyectos de investigación becados por el Fondo de Investigaciones Sanitarias, Sociedad Española de Neumología y Cirugía Torácica y Sociedad Madrileña de Neumología y Cirugía Torácica.
• Participación como investigador principal e investigador secundario en más de 50 ensayos clínicos, principalmente en las áreas de enfermedad pulmonar obstructiva crónica, asma, fibrosis pulmonar e infecciones respiratorias.
• Profesor asociado de Medicina, Universidad Europea de Madrid desde septiembre de 2010.

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Capítulos de libros:

• José Ma. Echave-Sustaeta, Lorena Comeche Casanova. Asistencia respiratoria. En: Manual de enfermedades neuromusculares. Gutierrez Rivas E. SEN. 2016 Madrid () Capítulo 61).
• Echave-Sustaeta María Tomé JM, Comeche Casanova L. Afectación respiratoria en las enfermedades neuromusculares. En: Neumología clínica. Álvarez-Sala Walther JL, Casan Clarà P, Rodríguez de Castro F, Rodríguez Hermosa JL, Villena Garrido V, eds. 2ª ed. Madrid: Elsevier. 2015 (Capítulo 84).
• José Ma. Echave-Sustaeta, Ricardo García Luján. Oxigenoterapia. Indicaciones y controversias. Ventilación mecánica en la EPOC. En Actualizaciones en la EPOC. Monografias Neumomadrid. Volumen XV/2010. Editorial Ergón.
• José Ma. Echave-Sustaeta, Ricardo García Luján, Virginia Pérez Pérez Controversias en ventilación mecánica domiciliaria: el paciente con EPOC estable. En: Ventilación mecánica no invasiva. Monografias Neumomadrid. Volumen IX/2007. Editorial Ergón.
• Echave-Sustaeta JM, Villena Garrido V. Valoración del riesgo respiratorio: pruebas de función respiratoria. Monitorización en anestesia, cuidados críticos y medicina de urgencias. Francisco de Borja de la Quintana Gordon, Carlos Chamorro, Antonio Planas y Eloísa López (Editores). Editorial Elsevier España. 2004, Madrid. ISBN 84-8174-708-4.
• Echave-Sustaeta JM, Castellanos Maroto J. Insuficiencia respiratoria. En: López Encuentra A, Martín Escribano P (eds.). Neumología en Atención Primaria. Ediciones Aula Médica. Madrid 1999: 161-173.
• Echave-Sustaeta JM, Villena Garrido V. Sarcoidosis. En: López Encuentra A, Martín Escribano P (eds.). Neumología en Atención Primaria. Ediciones Aula Médica. Madrid 1999: 417-426.
• Villena Garrido V, Echave-Sustaeta JM. Enfermedad pulmonar intersticial difusa. Alveolitis fibrosante criptogenética. En: López Encuentra A, Martín Escribano P (eds.). Neumología en Atención Primaria. Ediciones Aula Médica. Madrid 1999: 405-416.
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• Díaz de Atauri y Rodriguez de los Ríos MJ, Alvarez Martinez C, Echave-Sustaeta María Tomé J. Fisiopatología. En: Martín Escribano P. Clínicas Médicas de España: Enfermedad Pulmonar Obstructiva Crónica. Editorial médica Panamericana. Madrid 1998: 81-105.
• Echave-Sustaeta María Tomé J, Villena Garrido V, Díaz de Atauri y Rodriguez de los Ríos MJ. Diagnóstico. En: Martín Escribano P. Clínicas Médicas de España: Enfermedad Pulmonar Obstructiva Crónica. Editorial médica Panamericana. Madrid 1998: 125-153.
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• Echave-Sustaeta JM, Cienfuegos Agustín MI. Ventilación mecánica domiciliaria. En: Martín Escribano P, López Ecuentra A. Pautas de Práctica Clínica en Neumología (Algoritmos clínicos y procedimientos). Idepsa. Madrid, 1996: 234-243.
• Donado Uña JR, Echave-Sustaeta JM. Patología neumológica en infección por el VIH. En: Martín Escribano P, López Ecuentra A. Pautas de Práctica Clínica en Neumología (Algoritmos clínicos y procedimientos). Idepsa. Madrid, 1996: 113-123.
• Echave-Sustaeta JM, Villena MV, López Encuentra A, Izquierdo M, Alvarez C, Martín Escribano P. Etiología del derrame pleural en un servicio de neumología. Estudio de una serie de 235 pacientes. En Aportaciones a la Medicina Interna. 12th Congress of the European Association of internal Medicine. XXI Congreso Nacional de la Sociedad española de Medicina Interna. Editorial Libro del Año. Madrid, 1995: 249-253.
• Villena MV, Echave-Sustaeta J, López Encuentra A, Martín Escribano P, Navarro JA, Arenas J. Diagnóstico de la tuberculosis pleural mediante adenosina desaminasa, lisozima o biopsia pleural. En Aportaciones a la Medicina Interna. 12th Congress of the European Association of internal Medicine. XXi Congreso Nacional de la Sociedad española de Medicina Interna. Editorial Libro del Año. Madrid, 1995: 215-219.
• Echave-Sustaeta J, González Garrido F, Linares Asensio MJ. Insuficiencia respiratoria aguda. En: Carnevali Ruiz D, Medina Iglesias P, Pastor Valverde C, Sanchez Manzano D, Satué Bartolomé JA (editores). Manual de Diagnóstico y Terapéutica Médica, 12 de Octubre, 3ra. edición.
• González Garrido F, Echave-Sustaeta J, de Pablo Gafas A. Tromboembolismo venoso. En: Carnevali Ruiz D, Medina Iglesias P, Pastor Valverde C, Sanchez Manzano D, Satué Bartolomé JA (editores). Manual de Diagnóstico y Terapéutica Médica, 12 de Octubre, 3ra. edición.

• Presentación de numerosas comunicaciones a congresos nacionales e internacionales.
• Ponente y moderador de mesas y comunicaciones en los congresos de la Sociedad Europea de respiratorio (ERS), Sociedad Española de Neumología (SEPAR) y Sociedad Madrileña de Neumología (NEUMOMADRID).

• Miembro de la Sociedad Española de Neumología y Cirugía Torácica desde 1991.
• Miembro de la Sociedad Madrileña de Neumología y Cirugía Torácica desde 1994
• Miembro de la European Respiratory Society desde 1996.